故事发生在名为星元市的宁静小城，市内的狮子尾山上耸立着一座闪耀着彩色光芒的巨大物体，被命名为“摩诺之角”。这其实是十六年前“怪兽之日”事件发生后便一直矗立于此的“怪兽之角”，见证着那段改变世界的历史。自那日起，全球各地怪兽频发，灾害逐渐成为了人们日常生活的一部分，时刻威胁着城市的安全。
面对日益严峻的怪兽危机，日本的地球防卫队选择以武力手段进行正面迎击。与此同时，怪兽防灾科学调查所（简称 SKIP）则致力于通过科学调查与避难引导，从源头防止灾害发生并控制受灾范围。该组织至今仍在不懈地追查“怪兽之日”的成因，并深入探究城市中“摩诺之角”背后隐藏的秘密。
年仅七岁的少年优马曾在狮子尾山与父母露营时遭遇怪兽袭击，却奇迹般地毫发无伤地生还。这段痛苦而特殊的经历成为他人生的转折点，促使他长大后毅然踏上了研究怪兽生物学的道路。如今，带着对过去的记忆与对未来的期许，优马将在新的危机中与光同行，揭开笼罩在星元市上空的真相。
