宇宙深处曾散落着被粉碎的恶魔碎片，这些残留的邪恶力量至今仍在各个星系引发混乱。一名身份成谜的恶徒利用这些碎片四处作祟，甚至将侵略的魔爪伸向了象征正义的光之国。面对前所未有的危机，赛罗奥特曼与其徒弟泽塔奥特曼挺身而出，毅然决然地正面迎击来犯之敌。
在一场激烈的宇宙交锋后，泽塔奥特曼独自追击逃逸的怪兽，一路追踪至蔚蓝的地球。为了应对日常频发的怪兽灾害，地球上成立了专门的防卫组织——怪兽应对机甲部队“军械库”。这支队伍中有一位充满热血的青年队员夏川春树，他时刻准备着为守护人类而战。
当巨大的宇宙怪兽降临地球之际，泽塔奥特曼与夏川春树命运般地相遇了。两个同样怀揣炽热信念的灵魂就此产生共鸣，共同开启了这段波澜壮阔的战斗篇章。他们携手驾驭机甲与奥特力量，在一次次生死考验中对抗被恶魔碎片操控的怪物，誓要终结这场跨越星系的祸乱。
