本片是一部融合喜剧元素的惊险科幻作品，故事始于美国一家飞行器导航实验室遭非法组织洗劫。原本计划注入兔子体内的微型尖端飞行器，在混乱中被项目负责人奥兹博士紧急注入超市售货员杰克·迈克体内。患有间歇性高度兴奋症的杰克回家后，不仅听到体内传来神秘声音，更随即遭到不明杀手的疯狂追杀。
潜入杰克体内的正是“叛逆宇航员”塔克驾驶的微型飞行器，他通过杰克的视网膜和神经系统与其对话并指挥战斗。由于飞行器氧气仅能维持到次日清晨九点，两人必须尽快找回被抢走的集成电路板以实现还原。塔克意外发现杰克的前女友莉迪娅正调查此案，便操控杰克引起这位报社记者的注意，让她也卷入这场危机。
莉迪娅在接触中惊讶于杰克对自己私密细节的了解，而这其实源自曾与她有过肌肤之亲的塔克的记忆。为接近幕后黑手斯克雷蒙，塔克启动电子模拟系统改变杰克容貌，成功伪装成受雇偷窃电路板的惯偷“牛仔”。虽然身份细微变化被识破导致二人被绑架，但杰克在混乱中侥幸夺回了关键的还原电路板。
在实验室里，斯克雷蒙将另一艘微型飞行器注入杰克体内试图消灭塔克，两艘飞船在杰克胃液中展开殊死搏斗。最终塔克占据上风，敌对飞行器被强酸腐蚀化为乌有，但塔克自身的氧气储备也已濒临极限。杰克与莉迪娅飞驰赶回实验室，利用夺回的电路板成功将塔克还原，不仅挽救了科学实验，也修复了塔克与莉迪娅之间濒临破碎的爱情。
