少林寺数百年来弘扬武学，曾为太平盛世立下不朽功勋。然而清廷为打压异己、控制民心，竟勾结少林叛徒石少锋等人围攻寺院，致使众多弟子流落四方。在此危难之际，大智禅师的得意门生云飞功夫大成，奉师命下山保护反清义士并清理门户。
云飞在途中得到热心少年谭小弟的协助，成功混入石少锋盘踞的白石镇。此时众义士正搭救一名少林子弟，却因石少锋早有埋伏而惨遭重创，其得力助手杜清更是出手狠辣，杀伤无数。云飞试图接近杜清并假意投靠敌方，企图从内部瓦解敌人，不料计谋被石少锋识破，身陷囹圄。
关键时刻，谭小弟再次挺身而出，凭借机智与勇气将云飞救出牢笼。原来谭小弟的兄长正是死于石少锋之手，新仇旧恨让两人决心合力诛杀此贼。为了增强实力，他们又邀请了一位因石少锋而失手害死爱人的剑术高手江南浪子加入阵营。
这群身怀绝技的英雄各怀悲愤，因共同的敌人走到一起，誓要铲除奸佞。面对势力庞大的石少锋一伙，他们必须依靠高超的武艺与默契的配合展开生死搏杀。在这场正邪对决中，少林精神将在血与火的考验下重新闪耀光芒。
