武侠剧《铁血大旗门》剧情迂回曲折，人物关系错综复杂，结局更是出人意表。故事始于云翼率领的大旗门，当年因护送宋帝昺失败而被迫归隐大漠。十五年后，云翼意图重出江湖，却因长子云铿与仇家之女冷青萍相恋而导致计划败露，不得不再次隐退。受此牵连，次子云铮及弟子铁中棠被逐出师门，从此踏上充满未知的江湖之路。
被逐后的两人遭遇仇家疯狂追杀，铁中棠不幸跌下悬崖，幸得水灵光及其母木柔颂出手相救。在朝夕相处中，铁中棠与水灵光互生情愫，却惊觉二人竟是同父异母的兄妹，陷入伦理与情感的双重煎熬。与此同时，云铮邂逅了司徒笑的养女温黛黛，她本奉命接近云铮以打探大旗门下落，最终却被其真情打动，毅然改邪归正。
随着剧情推进，铁中棠与云铮迭遭奇遇，武功日益精进，但兄弟间却因误会而产生裂痕。云铮误以为铁中棠背叛门派秘密，竟冒死勇闯日帝月后所在的长春岛，途中险象环生，惊险重重。在经历重重磨难后，铁中棠终于揭开了自己与水灵光的身世真相，所有谜团随之浮出水面。全剧高潮迭起，将江湖恩怨与儿女情长演绎得淋漓尽致。
