故事发生在名为星元市的宁静小城，市内的狮子尾山上矗立着一座散发着彩色光芒的巨大物体，被称作“摩诺之角”。这实际上是十六年前“怪兽之日”事件后遗留下来的怪兽之角，见证了那个改变世界的时刻。自那日起，全球各地怪兽频发，灾害逐渐演变为日常生活的一部分，彻底打破了原本的和平秩序。
面对日益严峻的威胁，日本地球防卫队选择以武力正面迎击怪兽，而另一组织“怪兽防灾科学调查所”则采取了不同的策略。该机构简称 SKIP，致力于通过科学调查与避难引导来预防灾害发生并控制损失范围。时至今日，他们仍在不懈地探究“怪兽之日”的成因，并持续监视着城市中那座神秘的“摩诺之角”。
年仅七岁的少年优马曾在狮子尾山与父母露营时遭遇怪兽袭击，却奇迹般地毫发无伤地生还。这段痛苦的经历成为他人生的转折点，促使他毅然踏上了研究怪兽生物学的道路。带着对过去的记忆与对未来的期许，优马将在科学与未知的交织中，迎接新的挑战与命运。
