东京湾畔矗立起一座名为"Edge of Ocean"的超巨大新设施，这里即将承办一场备受瞩目的首脑会议。为了保障安全，警方在会议预定举行的五月一日当天，部署了高达两万两千人的庞大警力。然而，就在这看似固若金汤的戒备之下，一场突如其来的大规模爆炸事件打破了平静，将整座城市卷入恐慌之中。
混乱现场出现了一个关键身影，他是警察厅秘密组织“零”的成员安室透。令人费解的是，爆炸并未发生在会议当日，而是提前引爆，安室背地里那些诡异的行为更让柯南嗅到了不寻常的气息。随着调查深入，现场证物上提取到的指纹竟与毛利小五郎过往留在警视厅的记录完全吻合，矛头直指这位沉睡的名侦探。
围绕着小五郎的逮捕行动，柯南与安室透之间展开了一场紧张激烈的智勇交锋。这个谜一般的男人究竟是潜伏的敌人，还是隐藏在暗处的盟友？一切真相似乎都指向一项正在无声倒计时的“极秘任务”，而巨大的阴谋正悄然笼罩在所有人头顶。
