在町田住宅区附近，地面突然发生大规模下沉，形成了一个巨大的深渊。与此同时，当地一百八十五户居民无一幸免，全部遭到残忍杀害。这起谜一般的恐怖事件显然非人类所为，却未留下任何有效线索。调查指向一位神秘老人以及被称为禁忌遗物的“杜尔吉之箱”，它们似乎与惨剧有着深层关联。
五年后，时间来到近未来的东京。这座城市表面繁荣巨大，实则已滑向毁灭边缘，沦为两极分化严重的犯罪都市。町田惨剧中唯一的幸存者申道兰丸，为了追寻当年事件的真相而投身警界。然而新的案件随即在涩谷爆发，官方虽称其为吸毒者引发的狂暴事件，现场情况却远非如此简单。
当申道等警察赶到时，亲眼目睹了正在肆意蹂躏人类的妖兽。危急关头，特殊机动搜查队第二课——通称“特公”的特殊公安部队员挺身而出。以六条樱为代表的特公成员，手中握着的并非枪械或警棍，而是专门用来斩杀妖兽的太刀。面对超自然的威胁，常规武力显得苍白无力，唯有这些特殊的战士能与之抗衡。
申道此刻终于明白，日本将在两年内面临彻底的毁灭。为了阻止这场注定到来的灾难，他毅然踏上了与妖兽殊死搏斗的悲惨道路。在这场关乎人类存亡的战斗中，过去的阴影与未来的危机交织在一起。申道必须揭开“杜尔吉之箱”的秘密，才能在绝望中寻找一线生机。
