解放战争后期，西线围歼战役胜局已定，国民党独立团残部却趁夜色向西溃逃。上级紧急调遣某师转战东线，并指派庄连长率领小分队，在当地军分区配合下持续追击这股敌军。残敌最终隐匿于黑山寺中待命，更棘手的是，部队内部爆发了严重传染病，局势错综复杂。
面对此况，追击部队接到明确指令：既要保护百姓安全、减少自身伤亡，又要设法迫降敌军并给予救治，以便后续甄别整编。庄连长得知当地韦医生心向共产党且医术精湛，本想寻求协助，不料敌方抢先一步将韦医生骗上山中。为打破僵局，庄连长等人乔装成韦医生的助手混入寺院，展开了一场特殊的潜入行动。
在寺院内部，我方人员与韦医生里应外合，一方面全力治疗病患、阻断疫情蔓延，守护当地百姓安康；另一方面暗中勘察坑道结构，寻找破局关键。经过周密部署，我方成功控制了疫情，并利用坑道救出了那些渴望脱离国民党阵营的士兵。最终，黑山寺恢复往日安宁，这场兼具剿匪与人道主义救援的特殊任务圆满落下帷幕。
