健、城二、武士和铁也这四位英雄，在夺回各自的世界后本已归位，却为了某个未明的目的，再次与笑一同跨越时空降临。他们闯入的是一个“恶魔党”肆虐、科学忍者队日夜苦战的熟悉战场，但空气中弥漫着诡异的违和感。当创立者南部博士带着陌生的冷笑宣称他们是敌人时，连曾并肩作战的神鹰乔也在楼顶投下审视的目光，一场四大英雄的全新激斗就此拉开序幕。
影片的动作场面依旧保留了三维 CG 独有的夸张张力，那种超越人体极限的高速搏斗，让人想起《黑客帝国》般的大胆迫力，这在当今超级英雄电影中实属罕见。然而剧本却显得颇为拘谨，仿佛是用八十年代的昭和老梗强行套上现代二线工艺，价值观透着股陈旧的“大老爷”气息。虽然那些不加修饰的软科幻设定意外地不显中二，但也掩盖不了信息量稀疏和打斗密度不足的尴尬，整体观感难免让人觉得经费捉襟见肘。
对于没看过旧作的观众来说，这片子门槛颇高，过度依赖《科学小飞侠》的既有设定让人看得云里雾里。剧情过分聚焦于健的个人线，导致其他三位英雄沦为打酱油的工具人，新增的国外组织线索也显得鸡肋无比。画面虽继承了前作风格却缺乏新意，整部作品更像是一份给老粉丝的勉强交代，既无突破也无惊喜，最终只留下一声平淡的叹息。
