八国联军攻陷北京，朝廷仓皇出逃，整个国家陷入前所未有的动荡与混乱之中。武术宗师黄飞鸿携父亲黄麒英、十四姨以及徒弟梁宽、鬼脚七等人，一路南下前往番禹，计划与早已在那里的十三姨、猪肉荣和牙擦苏汇合。然而旅途并不平静，师徒一行因担心海盗劫掠粮仓，与当地南粤米仓的守卫发生了激烈误会。
双方在冲突中不打不相识，黄飞鸿更出手相助，将涉嫌盗米的贼人扭送官府受审。随着调查深入，真相令人震惊：所谓的盗米案竟是差役领班谢四暗中指使。原来南海海盗趁乱肆虐，番禹地区早已失去官员统制，基层差役为求生存，不得已才靠偷盗米粮维持口粮。
感念谢四等人在乱世中仍存忠义之心，黄飞鸿毅然放弃了原本赴港的行程。他决定留在当地，挺身而出对抗猖獗的海盗势力。面对单眼英、张玉麟、张保仔等一众悍匪，黄飞鸿带领众人展开了一场场惊心动魄的生死搏杀。
作为徐克执导的黄飞鸿系列第五部作品，本片延续了该系列家国情仇与侠义精神并重的风格。在清末民初的宏大背景下，影片不仅展现了精彩的功夫对决，更刻画了小人物在时代洪流中的挣扎与坚守。黄飞鸿以武止戈，用热血守护了一方百姓的安宁。
