在人类大规模向宇宙殖民的遥远时代，人口膨胀至五千亿的族群纷纷返回故土，却因此引发了伤亡惨重的归乡战争。为了守护这片满目疮痍的地球圣地，人类联合制定了严苛的“盖亚制裁”，严禁任何人随意染指。然而，曾经担任联合舰队舰长的哈洛克毅然背叛了这一铁律，驾驶着传奇战舰阿尔卡迪亚号高举叛旗，成为了逃逸百年的头号通缉犯。
面对哈洛克的挑战，联合舰队长官伊索拉派遣自己的弟弟亚马潜入阿尔卡迪亚号内部。亚马肩负着双重使命，既要监视这位传奇船长的动向，更要探寻传说中由尼伯龙根人发明的永动机秘密。在这艘充满神秘色彩的飞船上，亚马逐渐目睹了哈洛克与其船员们独特的生存方式，内心开始产生动摇。
与此同时，哈洛克率领着他的部下坚定不移地向地球挺近，一场关乎人类命运的风暴正在酝酿。影片改编自松本零士的经典科幻漫画，由荒牧伸志执导，集结了小栗旬、三浦春马、苍井优等知名声优倾情献声。故事在宏大的宇宙背景下，深刻探讨了自由、责任与家园的意义，展现了一段跨越百年的悲壮史诗。
