青蛇青青与白蛇素素情同姊妹，在灵雨山庄中过着逍遥自在的生活。两蛇偶遇奉母命寻妻的穷书生宁丹，本欲戏弄一番，谁知素素对宁丹一见钟情，主动要求调换主仆身份以接近他。然而青青也被宁丹的孝心打动，虽碍于姐妹情谊刻意疏远，却仍让宁丹心生好感，使其陷入迎娶素素却心系青青的两难境地。
邻近山洞的黑蝙蝠觊觎素素已久，趁偷袭之际将青青与宁丹逼入绝境。二人以为命不久矣而发生关系，脱险后却被迫分离。素素得知真相后受黑蝙蝠煽动，设计让青青在宁丹面前现身并加以离间，导致青青黯然怀着身孕远去。
十六年后，宁丹在素素帮助下成为“药仙”，与素素及子女宁静、宁叶定居仙霞镇。实则宁叶是当年黑蝙蝠奸污素素所生，天生魔性，素素只得用法力压制并让其过凡人生活以消退妖气。与此同时，青青携子明声隐居仙霞山采药修道，容颜未改，道行更深的她本想从此斩断尘缘。
捉妖人石头道初时误会青青，直到宁丹遇险被救，青青仍以明声之母自居不肯相认。黑蝙蝠再现并利用宁叶的魔性，致其狂性大发伤及宁丹，迫使青青为救人而承认身份。随着宁叶妖性彻底爆发，宁丹终于知晓其身世真相及素素当年的恶行，毅然离开素素选择面对过去，一场正邪与人情的终极对抗就此展开。
