穷困潦倒的漫画家刘神在创作低谷期，意外目睹了外星使徒入侵地球的恐怖场景。就在危机时刻，学生时代的女神吴绍君驾驶着巨大的末日机甲初号机从天而降，将他从绝境中拯救出来。然而个人的幸存无法扭转大局，地球最终仍未能逃脱被使徒肆虐毁灭的命运。
为了改变这悲惨的结局，刘神获得了一次穿越时空的机会，回到了充满回忆的高中时代。重生后的他再次遇到了曾经的挚友赵承德以及年少时的女神吴绍君，熟悉的面孔让他决心改写众人的命运。这一次，他不仅要帮助挚友摆脱未来惨淡的人生轨迹，还要全力追求心仪的太妹女神郑好。
刘神与吴绍君携手启动了一项特殊的“青春补完计划”，试图在享受校园时光的同时暗中布局。他们在日常相处中逐渐拼凑出线索，发现使徒入侵地球的背后隐藏着令人震惊的真相。随着计划一步步推进，原本看似普通的青春故事背后，一场关乎世界存亡的宏大博弈悄然展开。
